{"id":450,"date":"2025-05-23T12:00:49","date_gmt":"2025-05-23T10:00:49","guid":{"rendered":"https:\/\/www.minesparis.psl.eu\/cbio\/?page_id=450"},"modified":"2025-07-08T10:10:30","modified_gmt":"2025-07-08T08:10:30","slug":"projets","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.minesparis.psl.eu\/cbio\/recherche\/projets\/","title":{"rendered":"Projets"},"content":{"rendered":"\n
Le CBIO m\u00e8ne plusieurs projets structurants, financ\u00e9s par des institutions nationales ou europ\u00e9ennes, souvent en partenariat avec d\u2019autres centres de recherche ou acteurs cliniques.<\/strong><\/p>\n\t\t<\/div>\n\t<\/div>\n<\/div>\n\n\n \u00c9tude des \u00e9l\u00e9ments transposables et de leur variation \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique dans la relation g\u00e9notype-ph\u00e9notype. Ce projet, en partenariat avec des biologistes de l\u2019ENS \u2013 PSL, explore l\u2019impact de ces \u00e9l\u00e9ments dans les traits complexes, avec des applications en sant\u00e9 humaine et en agriculture.<\/em><\/p>\n\t\t<\/div>\n\t\t D\u00e9veloppement d\u2019un outil non invasif de diagnostic pr\u00e9coce du cancer du poumon, en collaboration avec l\u2019Universit\u00e9 de Cambridge. Le projet repose sur l\u2019analyse d\u2019images biom\u00e9dicales et de donn\u00e9es transcriptomiques \u00e0 l\u2019aide de m\u00e9thodes statistiques et d\u2019apprentissage automatique.<\/em><\/p>\n\t\t<\/div>\n\t\t Mod\u00e9lisation pr\u00e9dictive de la survie des patients atteints d\u2019un cancer de la vessie infiltrant le muscle, trait\u00e9s par chimioth\u00e9rapie n\u00e9oadjuvante. Le projet vise \u00e0 am\u00e9liorer la stratification des patients \u00e0 partir de lames anatomopathologiques.<\/em><\/p>\n\t\t<\/div>\n\t<\/div>\n<\/div>\n\n\n Les travaux ant\u00e9rieurs du CBIO ont donn\u00e9 lieu \u00e0 des publications majeures et \u00e0 des innovations m\u00e9thodologiques en bio-informatique, sant\u00e9 et biologie computationnelle :<\/strong><\/p>\n\t\t<\/div>\n\t<\/div>\n<\/div>\n\n\n Les projets par th\u00e9matiques :\n<\/strong><\/p>\n Ces projets ont conduit \u00e0 :<\/p>\nANR \u2013 STEVE<\/span><\/h3>\n
Carnot M.I.N.E.S.<\/span><\/h3>\n
PRTK \u2013 SELECT<\/span><\/h3>\n
Les projets du CBIO<\/h2>\n
Komet \u2013 Pr\u00e9diction d\u2019interactions m\u00e9dicament-cible \u00e0 grande \u00e9chelle<\/span><\/h3>\n
\n
\nComSeg \u2013 Analyse des tissus complexes par transcriptomique spatiale<\/span><\/h3>\n
\n
\nMod\u00e9lisation \u00e9volutive des g\u00e9nomes bact\u00e9riens<\/span><\/h3>\n
\n
\nD\u00e9tection de la d\u00e9ficience en recombinaison homologue (HRD)<\/span><\/h3>\n
\n
\nNouvelles approches th\u00e9rapeutiques et m\u00e9decine personnalis\u00e9e<\/span><\/h3>\n
\n
Fondation Maladies Rares, 2020\u20132021<\/em>
Utilisation de mod\u00e8les de machine learning pour identifier des compos\u00e9s actifs contre la mucoviscidose.<\/li>\n
Collaboration avec SANOFI, 2016\u20132019<\/em>
D\u00e9veloppement d\u2019algorithmes pour d\u00e9tecter des associations g\u00e9nome-ph\u00e9notype dans des cohortes humaines.<\/li>\n
EC-FP7, 2012\u20132016<\/em>
R\u00e9seau de formation doctorale autour de l\u2019IA pour la m\u00e9decine de pr\u00e9cision.<\/li>\n
ANR, 2012\u20132013<\/em>
Validation d\u2019une signature immunitaire pr\u00e9dictive de la r\u00e9ponse aux anthracyclines dans le cancer du sein.<\/li>\n
INCA, 2012\u20132014<\/em>
Ciblage de la prot\u00e9ine TYRO3 comme nouvelle piste th\u00e9rapeutique contre le cancer.<\/li>\n<\/ul>\n
\nAnalyse omique et bio-informatique des donn\u00e9es massives<\/span><\/h3>\n
\n
ANR, 2014\u20132018<\/em>
\u00c9tude syst\u00e9matique de l\u2019expression g\u00e9nique \u00e0 l\u2019\u00e9chelle de la mol\u00e9cule d\u2019ARN, par hybridation in situ.<\/li>\n
ANR \u2013 Investissements d\u2019avenir, 2012\u20132016<\/em>
Algorithmes et logiciels pour le s\u00e9quen\u00e7age haut d\u00e9bit.<\/li>\n
EC-FP7, 2012\u20132015<\/em>
D\u00e9veloppement rapide et diffusion d\u2019outils statistiques pour le s\u00e9quen\u00e7age \u00e0 haut d\u00e9bit.<\/li>\n
Ligue contre le cancer, 2011\u20132014<\/em><\/li>\n
Collaboration avec BioM\u00e9rieux, 2011\u20132014<\/em>
Apprentissage structur\u00e9 appliqu\u00e9 \u00e0 la spectrom\u00e9trie de masse et au s\u00e9quen\u00e7age.<\/li>\n<\/ul>\n
\nR\u00e9seaux de r\u00e9gulation et d\u00e9veloppement<\/span><\/h3>\n
\n
ANR, 2015\u20132019<\/em>
\u00c9tude des r\u00e9seaux de r\u00e9gulation dans le d\u00e9veloppement des cellules de la cr\u00eate neurale.<\/li>\n
ANR, 2012\u20132014<\/em>
Approches int\u00e9gratives pour mod\u00e9liser les r\u00e9seaux de r\u00e9gulation dans l\u2019induction de la cr\u00eate neurale.<\/li>\n
ANR, 2009\u20132013<\/em>
Algorithmes de clustering en haute dimension.<\/li>\n<\/ul>\n
\nImagerie, microscopie et diagnostic<\/span><\/h3>\n
\n
2007\u20132011<\/em>
Microscopes \u00e0 haute r\u00e9solution pour le criblage de mol\u00e9cules anticanc\u00e9reuses.<\/li>\n
ANR, 2007\u20132009<\/em>
Suivi de la toxicit\u00e9 des nanoparticules.<\/li>\n
EC-FP7, 2010\u20132015<\/em>
Nanosyst\u00e8mes pour le diagnostic pr\u00e9coce des maladies neurod\u00e9g\u00e9n\u00e9ratives.<\/li>\n
EC-FP7, 2005\u20132008<\/em>
Biocapteurs fluorescents \u00e0 haute sensibilit\u00e9 pour des applications diagnostiques.<\/li>\n<\/ul>\n
\nR\u00e9seaux europ\u00e9ens et infrastructures collaboratives<\/span><\/h3>\n
\n
EC-FP7, 2013\u20132015<\/em><\/li>\n
EC-FP7, 2005\u20132007<\/em><\/li>\n<\/ul>\n
\nM\u00e9thodes statistiques et apprentissage automatique<\/span><\/h3>\n
\n
ERC, 2012\u20132017<\/em>
Algorithmes pour donn\u00e9es biologiques complexes.<\/li>\n
ANR, 2007\u20132011<\/em><\/li>\n
JSPS, 2003\u20132005<\/em>
Analyse statistique et combinatoire de r\u00e9seaux biologiques.<\/li>\n
France-Berkeley Fund, 2007\u20132009<\/em>
Applications \u00e0 la bio-informatique et \u00e0 la reconnaissance vocale.<\/li>\n
CNRS, 2004\u20132006<\/em>
Th\u00e9orie de l\u2019apprentissage statistique pour donn\u00e9es structur\u00e9es.<\/li>\n
CNRS, 2003\u20132004<\/em><\/li>\n<\/ul>\n
\nOutils bio-informatiques et infrastructure<\/span><\/h3>\n
\n
CEA, 2005\u20132006<\/em>
M\u00e9thodes et outils bio-informatiques pour l\u2019analyse de puces \u00e0 ADN.<\/li>\n
CNRS, 2004\u20132007<\/em>
Int\u00e9gration des donn\u00e9es d\u2019expression et des r\u00e9seaux de r\u00e9gulation.<\/li>\n
Mines Paris, 2004\u20132007<\/em>
Analyse des effets de m\u00e9dicaments antipaludiques sur Plasmodium falciparum<\/em>.<\/li>\n
JSPS, 2008\u20132010<\/em><\/li>\n<\/ul>\n
\nImpact scientifique<\/h2>\n
\n