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La recherche au centre de bio-informatique vise à développer des modèles et des algorithmes pour analyser et comprendre les données biologiques et chimiques, en particulier à travers des modèles probabilistes et des algorithmes d'apprentissage statistique. L’objectif sur le long terme est, à travers de multiples collaborations, de contribuer au développement de nouvelles thérapies en particulier contre le cancer. Afin d'atteindre ces buts les projets s'articulent autour de 5 axes:
Clarice Groeneveld, Virginia Sanchez-Quiles, Florent Dufour, Mingjun Shi, Florent Dingli, Rémy Nicolle, Elodie Chapeaublanc, Patrick Poullet, Daniel Jeffery, Clémentine Krucker, Pascale Maillé, Francis Vacherot, Dimitri Vordos, Simone Benhamou, Thierry Lebret, Olivier Micheau, Andrei Zinovyev, Damarys Loew, Yves Allory, Aurélien de Reyniès, Isabelle Bernard-Pierrot, François Radvanyi. Proteogenomic Characterization of Bladder Cancer Reveals Sensitivity to Apoptosis Induced by Tumor Necrosis Factor?related Apoptosis-inducing Ligand in FGFR3-mutated Tumors European Urology, 2023, ⟨10.1016/j.eururo.2023.05.037⟩
Sandra Curras-Alonso, Juliette Soulier, Thomas Defard, Christian Weber, Sophie Heinrich, Hugo Laporte, Sophie Leboucher, Sonia Lameiras, Marie Dutreix, Vincent Favaudon, Florian Massip, Thomas Walter, Florian Mueller, José-Arturo Londoño-Vallejo, Charles Fouillade. An interactive murine single-cell atlas of the lung responses to radiation injury Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.2445. ⟨10.1038/s41467-023-38134-z⟩
Arthur Imbert, Florian Mueller, Thomas Walter. PointFISH -- learning point cloud representations for RNA localization patterns Preprint, 2023
Tristan Lazard, Marvin Lerousseau, Etienne Decencière, Thomas Walter. Giga-SSL: Self-Supervised Learning for Gigapixel Images Preprint, 2023
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